Топливо МТБЭ в основном используется как добавка к бензину, у него отличные антидетонационные свойства, повышает октановое число и также может быть разложено для производства изобутилена. Оно хорошо смешивается с бензином, плохо впитывает воду и не загрязняет окружающую среду. Может быть улучшено для использования как аналитический растворитель и экстрагент. Используется как десорбент в хроматографии, особенно в высокоэффективной жидкостной хроматографии. Образует азеотропы с некоторыми полярными растворителями, такими как вода, метанол и этанол. Метилтрет-бутиловый эфир также обладает слабым анестетическим эффектом. Хранить в прохладном и проветриваемом складе. Держать подальше от огня и источников тепла. Температура хранения не должна превышать 37 ºC. Держать контейнер герметично закрытым. Помещение должно храниться отдельно от окислителя, смешанное хранение запрещено. Следует использовать взрывобезопасное освещение и вентиляционное оборудование. Запрещено использовать механическое оборудование и инструменты, способные легко генерировать искры.